W akwarium nawet w warunkach ustabilizowanych procesów przemiany materii, mimo wszystko odkładają się niektóre jej produkty, m.in. białka - albuminy jak np. w kożuchu na mleku czy kurzym jaju. Tworzą one wraz z bakteriami śliską błonkę, a przy przewietrzaniu lub ruchu wody (w akwarium morskim zawsze) dość trwałą pianę na powierzchni wody. Z uwagi na to należy stosować w akwarium odpieniacz, przynajmniej co pewien czas. Strumień wody napędzany przez powietrze, wydostające się z kamienia przewietrzacza, powoduje powstawanie owej piany, ale w obrębie odpieniacza, skąd łatwo się ją usuwa.
Ozonizator to inny specjalistyczny sprzęt, dość modny, ale ryzykowny w użyciu. Zawiera on filtr lub komorę, w której z wodą miesza się powietrze z ozonem. Gaz ten dostaje się do akwarium i zabija większość drobnoustrojów, w tym owe pożyteczne bakterie w podłożu, a zatem może zniszczyć pieczołowicie „budowaną" równowagę biologiczną. Z drugiej strony ozon utlenia azotyny, dlatego niektórzy sądzą, że można w ten sposób zastąpić działanie filtru biologicznego. W większej dawce ozon drażni ryby, może nawet je otruć.
Należy również zachować ostrożność przy stosowaniu sterylizatora z lampą kwarcową. Używa się go do naświetlania promieniami ultrafioletowymi przechodzącej przezeń wody, co ma zabijać przynajmniej część chorobotwórczych organizmów, unoszących się w wodzie akwarium, natomiast nie wpływa na mikroorganizmy ukryte w podłożu.
W skład specjalistycznego sprzętu wchodzi także filtr okrzemkowy - pojemnik podłączany do pompy turbinowej. Materiałem filtrującym jest w nim warstwa szkielecików morskich okrzemek - mikroskopijnych glonów. Filtr ten jest bardzo efektywny, zatrzymuje nawet jednokomórkowe pasożyty. W rezultacie tego bardzo szybko się zapycha, zatem urządzenie takie wymaga ciągłego czyszczenia. Dla przeciętnego akwarysty zupełnie wystarczy biologiczny filtr na dnie akwarium oraz filtr z pompą turbinową. Układ ten jest prosty w obsłudze.